top of page
TR: Fikirlerinin Patronu Ol: Yorgun Bilim İnsanının Dünyayı (ve Patentleri) Ele Geçirme Rehberi
Şu an bunu okuyorsan muhtemelen pipetleme yapmaktan beynin yandı, bin satırlık kodun derlenmesini bekliyorsun ya da o makalenin tartışma (discussion) kısmını yazmamak için kendine bahaneler üretiyorsun. Hoş geldin. Bizden zarar gelmez. İster bursunun yatmasını bekleyen bir doktora öğrencisi ol, ister kadro kovalayan bir doktora sonrası araştırmacı (postdoc), isterse proje raporları arasında boğulan genç bir hoca... Kariyerimizin başında hepimiz tek bir kutsal güce tapmak üzer
Alper KARAGÖL
Jan 44 min read
How to Own Your Ideas: The Exhausted Scientist’s Guide to World Domination (and Patents)
If you are reading this, you are probably taking a mental health break from pipetting, waiting for a massive code block to compile, or aggressively procrastinating on writing the discussion section of a paper you started six months ago. Welcome. You are in a safe space. As early-career scientists, whether you are a PhD candidate surviving on free seminar pizza, a postdoc hunting for permanent positions, or a junior faculty member drowning in grant applications, we are conditi
Alper KARAGÖL
Jan 45 min read
🍷 Laboratuvar Önlüğünü Çıkarıyoruz: Yılbaşı İçin Mükemmel "Sıvı" Optimizasyonu (Nam-ı Diğer Sıcak Şarap)
Bugün sizinle paylaşacağım protokol... pardon, tarif , sadece bir içecek değil; dopamin reseptörlerinizi uyaracak, termodinamik açıdan içinizi ısıtacak ve kesinlikle peer-review 'dan (yani arkadaş onayı) tam not alacak bir formülasyon. 🧪 Materyal ve Metot: İhtiyaç Duyulan Bileşenler Bu reaksiyonun substratları oldukça önemli. Hedefimiz maksimum aroma ekstraksiyonu ve optimum lezzet dengesi. Çözücü (Solvent): 2 şişe Kırmızı Şarap. (Çok pahalı bir şeye gerek yok, sonuçta on
Alper KARAGÖL
Dec 22, 20252 min read
Molecular Mechanics Poisson–Boltzmann Surface Area (MM-PBSA): A Physics-Based Perspective on Binding Free Energy
At its core, MM-PBSA is a framework for estimating the thermodynamic potential of molecular association, grounded in the canonical ensemble of statistical mechanics. The binding of a ligand (L) to a receptor (R) to form a complex (RL) can be rigorously described by the Helmholtz free energy difference: ΔG_bind = G_RL - (G_R + G_L) = -k_B T ln(Z_RL / (Z_R Z_L)), where each Z is a configurational partition function integrating over all atomic coordinates and solvent degrees of
Alper KARAGÖL
Oct 18, 20253 min read
Timing Is Everything: How I Learned to Avoid Bench Rejection and Choose the Right Journal
When I first started submitting my research, I thought the hard part was writing the manuscript. I’d finish my draft, do a quick...
Alper KARAGÖL
Aug 16, 20253 min read
Optimizing Early Research Resource Allocation
Resource allocation in the early stages of research is a critical factor that can determine the success or failure of a project. Whether...
Alper KARAGÖL
Feb 3, 20252 min read
bottom of page